HCAData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HCAData

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见HCAData

在R/Bioconductor中访问人类细胞图谱的数据集

Bioconductor版本:3.12

这个包允许直接访问由Human Cell Atlas项目生成的数据集,以便在R和Bioconductor中进行进一步处理,以singlecel实验对象的舒适格式(其他格式可在这里:http://preview.data.humancellatlas.org/)。

作者:Federico Marini [aut, cre]

维护者:Federico Marini

引文(从R内,输入引用(“HCAData”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("HCAData")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HCAData”)

超文本标记语言 R脚本 访问人类细胞图谱数据集
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubExpressionDataRNASeqDataSingleCellData
版本 1.6.0
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.6),SingleCellExperiment
进口 ExperimentHubAnnotationHubHDF5Array,跑龙套
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyle食物(> = 1.11.4),BiocSingular天窗RtsneigraphiSEEtestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/federicomarini/HCAData
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 HCAData_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HCAData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HCAData
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HCAData/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网