HCAData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HCAData

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见HCAData．

在R/Bioconductor中访问人类细胞图谱的数据集

Bioconductor版本:3.12

这个包允许直接访问由Human Cell Atlas项目生成的数据集，以便在R和Bioconductor中进行进一步处理，以singlecel实验对象的舒适格式(其他格式可在这里:http://preview.data.humancellatlas.org/)。

作者:Federico Marini [aut, cre]

维护者:Federico Marini

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("HCAData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HCAData”)

超文本标记语言	R脚本	访问人类细胞图谱数据集
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，ExpressionData，RNASeqData，SingleCellData
版本	1.6.0
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6)，SingleCellExperiment
进口	ExperimentHub，AnnotationHub，HDF5Array,跑龙套
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，食物(> = 1.11.4),BiocSingular，嘘，天窗，Rtsne，igraph，iSEE，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/federicomarini/HCAData
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HCAData_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HCAData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HCAData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HCAData/
软件包下载报告	下载数据