此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GSE62944.
Bioconductor版本:3.12
TCGA处理了24种癌症类型的9264个肿瘤和741个正常样本的RNA-Seq数据,并将其作为GEO登录[GSE62944](http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE62944)。GSE62944数据已解析为ExperimentHub中可用的summarizeexperiment对象。
作者:Sonali Arora
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“GSE62944”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GSE62944")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GSE62944”)
超文本标记语言 | R脚本 | 原始TCGA数据使用Bioconductor's ExperimentHub |
参考手册 |
biocViews | DNASeqData,ExperimentData,基因组,RNASeqData |
版本 | 1.18.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase,GEOquery |
进口 | |
链接 | |
建议 | ExperimentHub(> = 0.99.6),knitr,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/GSE62944.html |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GSE62944_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSE62944 |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSE62944 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GSE62944/ |
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