GGdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.GGdata

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.12版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅GGdata。

所有90个人类基因组单体型图CEU样本,47 k表达式,4毫米SNP

Bioconductor版本:3.12

数据处理人类基因组单体型图SNP报告范本,GWAS等等。

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GGdata”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,基因组,人类基因组单体型图,MicroarrayData,SNPData,SequencingData
版本	1.28.0
许可证	LGPL
取决于	R(> = 2.12.0)、方法Biobase(> = 2.5.5),GGBase,snpStats,illuminaHumanv1.db,AnnotationDbi
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了	GGtools
URL
取决于我	eQTL
进口我
建议我	crlmm,GGtools
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GGdata_1.28.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GGdata
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GGdata
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GGdata/
包下载报告	下载数据