FieldEffectCrc

DOI:10.18129 / B9.bioc.FieldEffectCrc

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅FieldEffectCrc

肿瘤,tumor-adjacent正常和健康的结直肠转录组SummarizedExperiment对象

Bioconductor版本:3.12

RNA-seq数据处理1139年人类原发性结直肠组织样本在三个表型,包括肿瘤、正常adjacent-to-tumor,健康,可作为突触ID syn22237139在synapse.org上。数据被解析成SummarizedExperiment对象可以通过ExperimentHub促进结果的再现性和扩展丹皮尔et al。(PMCID: PMC7386360, PMID: 32764205)。

作者:克里斯托弗·丹皮尔(aut (cre)Bioconductor包维护者(施)

维修工:克里斯托弗·丹皮尔< chd5n virginia.edu >

从内部引用(R,回车引用(“FieldEffectCrc”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FieldEffectCrc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“FieldEffectCrc”)

HTML R脚本 SummarizedExperiments结直肠的转录组
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ColonCancerData,ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,Homo_sapiens_Data,RNASeqData,ReproducibleResearch,SequencingData,组织
版本 1.0.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 跑龙套
进口 BiocStyle,RUnit,SummarizedExperiment,ExperimentHub(> = 0.99.6),AnnotationHub,DESeq2
链接
建议 knitr,rmarkdown,BiocGenerics,股东价值分析,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/FieldEffectCrc.html
BugReports https://github.com/Bioconductor/FieldEffectCrc/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 FieldEffectCrc_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FieldEffectCrc
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FieldEffectCrc
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/FieldEffectCrc/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网