此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DropletTestFiles.
Bioconductor版本:3.12
从基于液滴的单细胞协议生成的各种文件,用于测试DropletUtils中的函数。主要用于存储在singlecel实验对象形成之前直接从处理管道(如10X Genomics的CellRanger软件)中出来的文件。与其他包不同的是,这个包的设计不是为了提供可以立即进行分析的对象。
作者:Aaron Lun [ctb, cre]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内,输入引用(“DropletTestFiles”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DropletTestFiles”)
超文本标记语言 | R脚本 | 测试基于液滴的单单元实用程序的文件 |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData,SingleCellData |
版本 | 1.0.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | 跑龙套,ExperimentHub,AnnotationHub,S4Vectors |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,DropletUtils |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | DropletUtils |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DropletTestFiles_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DropletTestFiles |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DropletTestFiles |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DropletTestFiles/ |
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