此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见CopyhelpeR.
Bioconductor版本:3.12
此包包含运行Bioconductor包CopywriteR所需的辅助文件。它包含预组装的1kb bin gc含量和参考基因组hg18、hg19、hg38、mm9和mm10的可映射性文件。此外,它还包含一个黑名单过滤器,用于删除显示CNV的区域。文件存储为来自GenomicRanges Bioconductor包的GRanges对象。
作者:Thomas Kuilman
维护者:Oscar Krijgsman
引文(从R内,输入引用(“CopyhelpeR”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CopyhelpeR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“CopyhelpeR”)
R脚本 | CopyhelpeR | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,GenomicSequence,Homo_sapiens |
版本 | 1.22.0 |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.10) |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | 文案 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | CopyhelpeR_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyhelpeR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CopyhelpeR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CopyhelpeR/ |
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