该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅targetscan.hs.eg.db。
生物导体版本:3.12
targetscan miRNA的目标预测人类组装使用来自TargetScan网站的数据。通过寻找与每个miRNA的种子区域相匹配的保守的8mer和7mer位点的存在,可以预测miRNA的生物靶标。还确定的是种子区域中不匹配的位点,这些位点是通过保守3'配对来补偿的。在哺乳动物中,根据使用位点的上下文得分计算的靶向效力对预测进行排名。
作者:gabor csardi
维护者:James F. Reid
引用(从r内,输入引用(“ targetscan.hs.eg.db”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ targetscan.hs.eg.db”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 | ||
文本 | 执照 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,函数通道 |
版本 | 0.6.1 |
执照 | 文件执照 |
要看 | R(> = 2.7.0),方法,AnnotationDbi(> = 1.18.3) |
进口 | 方法,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 生物剂,,,,Eisa,,,,Isomirs |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | targetScan.hs.eg.db_0.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/targetscan.hs.eg.db/ |
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