代谢物图

doi:10.18129/b9.bioc.MetaboliteIdMapping

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅代谢物图

来自不同来源的代谢物ID的映射

生物导体版本:3.12

该软件包提供了九种不同代谢物ID格式及其通用名称的全面映射表。数据已从四个公开可用来源收集并合并,包括HMDB,Comptox仪表板,Chebi和Graphite Bioconductor R软件包。

作者:Sebastian Canzler [AUT,CRE]

维护者:塞巴斯蒂安·坎兹勒(Sebastian Canzler)<塞巴斯蒂安(Sebastian)。

引用(从r内,输入引用(“代谢物映射”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ agaboliteIdmapping”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“代谢物映射”)

html R脚本 代谢物图
PDF 参考手册

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,AnnotationHub,,,,CustomDbschema,,,,函数通道
版本 0.99.8
执照 GPL-3
要看 R(> = 4.0.0)
进口 AnnotationHub
链接
建议 马格里特,,,,石墨,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,蒂布尔,,,,Rappdirs,,,,XML,,,,readxl,,,,Stringr,utils,尼特
系统要求
增强
URL https://github.com/yigbt/metaboliteidmapping
取决于我
进口我
建议我 多人
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 代谢IDMapping_0.99.8.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/metaboliteidmapping/
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