XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38．

智人的额外SNP位置(dbSNP Build 144)

Bioconductor版本:3.12

从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人额外SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建，包含映射到参考基因组GRCh38的snp。p2 (GRCh38的补丁版本，不改变染色体1-22,X, Y, MT)。而snplc . hapiens . dbsnp144。GRCh38包仅包含“snp”类的分子变异，该包包含其他类的分子变异(in-del、杂合、微卫星、命名位点、无变异、混合和多核苷酸多态性)。

作者:Herve Pages

维护:H. Pages

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens，XtraSNPlocs
版本	0.99.12
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，BSgenome
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，BSgenome
链接
建议	Biostrings，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	BSgenome
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/
软件包下载报告	下载数据