该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38。
生物导体版本:3.12
从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因150.该软件包使用的源数据文件是由NCBI在2017年3月12日至14日之间创建的,并包含用于参考Genome Grch38.p7的SNP(GRCH38的修补版本这不会改变染色体1-22,x,y,mt)。请注意,这些SNP可以“注入” bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38或bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38中。
作者:HervéPagès
维护者:fredhutch.org上的H.pagès
引用(从r内,输入引用(“ snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens,,,,snplocs |
版本 | 0.99.20 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | BSGENOME(> = 1.43.4) |
进口 | 方法,utils,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,BSGENOME |
链接 | |
建议 | 生物弦,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 特雷娜 |
建议我 | |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38_0.99.20.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38/ |
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