snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38

doi：10.18129/b9.bioc.snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38。

HOMO SAPIENS的SNP位置（DBSNP构建149）

生物导体版本：3.12

从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因149.该软件包使用的源数据文件是由NCBI在2016年11月8日至2日之间创建的，并包含映射的SNP，用于参考Genome Grch38.p7（GRCH38的修补版本这不会改变染色体1-22，x，y，mt）。请注意，这些SNP可以“注入” bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38或bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38中。

作者：HervéPagès

维护者：fredhutch.org上的H.pagès

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册

细节

生物浏览	AnnotationData，，，，遗传学，，，，homo_sapiens，，，，snplocs
版本	0.99.20
执照	艺术2.0
要看	BSGENOME（> = 1.43.4）
进口	方法，utils，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，BSGENOME
链接
建议	生物弦，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	mafdb.1kgenomes.phase1.grch38，，，，mafdb.1kgenomes.phase3.grch38，，，，mafdb.exac.r1.0.grch38，，，，mafdb.exac.r1.0.nontcga.grch38，，，，mafdb.gnomad.r2.1.grch38，，，，mafdb.gnomad.r3.0.grch38，，，，mafdb.gnomadex.r2.1.grch38，，，，mafdb.topmed.freeze5.hg38，，，，mafh5.gnomad.r3.0.grch38
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包装档案

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源包	snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38_0.99.20.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38/
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