BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked。

完整的蒙面基因组序列Taeniopygia guttata (taeGut1 UCSC的版本)

Bioconductor版本:3.12

完整基因组序列Taeniopygia guttata(斑胸草雀)提供的UCSC (taeGut1, 2008年7月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Tguttata.UCSC序列是一样的。taeGut1,除了他们每个人上面具后的2:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),和(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具)。面具都默认“活跃”。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,遗传学,Taeniopygia_guttata
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.11),BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1
进口	BSgenome,BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1
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包档案

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源包	BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked/
包下载报告	下载数据