BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked。

鼠形完全掩盖了基因组序列(UCSC rn4版)

Bioconductor版本:3.12

全基因组序列的鼠形(老鼠)提供的UCSC (rn4, 2004年11月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Rnorvegicus.UCSC序列是一样的。rn4,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,遗传学,Rattus_norvegicus
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4
进口	BSgenome,BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked/
包下载报告	下载数据