BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked。

亩骶蒙面基因组全序列(UCSC mm10版)

Bioconductor版本:3.12

完整基因组序列亩肌肉(鼠标)提供的UCSC (mm10, 2011年12月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Mmusculus.UCSC序列是一样的。mm10,除了他们每个人上面具后的2:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),和(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具)。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,遗传学,Mus_musculus
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
进口	BSgenome,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
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