BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10．

小家鼠全基因组序列(UCSC版本mm10)

Bioconductor版本:3.12

mususculus (Mouse)的完整基因组序列由UCSC提供(mm10, 2011年12月)并存储在Biostrings对象中。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,遗传学,Mus_musculus
版本	1.4.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.33.5)
进口	BSgenome
链接
建议	TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked
进口我	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked,GeneStructureTools,musicatk,trena
建议我	AneuFinder,BSgenome,circRNAprofiler,gcapc,GenomicRanges,InPAS,海市蜃楼,multicrispr,NADfinder,periodicDNA,scmeth,范围
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10/
软件包下载报告	下载数据