### R代码从vignette源'yaqcaffy。Rnw ' ################################################### ### 代码块1号:数据 ################################################### 库(yaqcaffy)图书馆(“affydata”)的数据(稀释)# #探针强度修改tmp < - exprs(稀释)tmp [1] < - tmp [1] * 2 exprs(稀释)< - tmp ################################################### ### 代码块2号:yaqc ################################################### yqc < - yaqc(稀释,verbose = TRUE)显示(yqc ) ################################################### ### 代码块3号:objectversion ################################################### objectVersion (yqc ) ################################################### ### 代码块数量4:plotqual ################################################### 情节(yqc ) ################################################### ### 代码块5号:离群值 ################################################### getOutliers (sfs yqc。 ") ################################################### ### 代码块6号:合并 ################################################### yqc2 < - yaqc(稀释[2:3])数组(yqc)数组(yqc2) yqc3 < - (yqc yqc2)数组(yqc3合并 ) ################################################### ### 代码块7号:myyaqccontolprobes (eval = FALSE ) ################################################### ## yqc < - yaqc (myAffyData myYaqcControlProbes = yaqcControlProbes ) ################################################### ### 代码块8号:maqcsubsetafx ################################################### 库(MAQCsubsetAFX)数据(refB) d < - refB [1] sampleNames (d ) ################################################### ### 代码块9号:reprodplot (eval = FALSE ) ################################################### ## reprodPlot (d,“refA”正常化= " rma ") ################################################### ### 代码块10号:reprodplorFig ################################################### reprodPlot (d,“测试”,规范化= "没有 ") ################################################### ### 代码块11号:sessioninfo ################################################### toLatex (sessionInfo ())