1.3.3版本变更------------------------- STAR融合导入功能新增:importFusionData o STAR运行功能新增:starInstallation o STAR安装功能新增:starRun o BiocParallel支持功能新增:STAR import fusionName supportingReads filterList 1.3.9版本变更------------------------- Rsubread aligner取代tophat。1.3.12版本的更改-------------------------- Picard-tools的新功能可以在chimara文件夹picardInstallation中下载。o包装器函数validateSamFile使用皮卡工具验证SAM/BAM文件。o包装器函数filterSamReads允许SAM和BAM过滤。在1.3.15版本的变化------------------------- GapFiller的新功能Nadalin等BMC生物信息学被实现为融合断点的全新验证工具。新增了一个prettyPrint函数,用于从fSet对象列表中生成一个表分隔的文件输出。添加了O混淆注释。1.7.1版本变更------------------------- Rsubread生成的fusion数据可以导入。1.7.10版本变更-------------------------新增特性支持导入fusionCatcher生成的融合数据。在1.9.2版本的变化-------------------------新功能的融合数据生成的tophat-fusion-post可以导入。 o Star import function was improved. o Annotation of fusion is more robust as it it is clearly linked to specific genomic releases. e.g. h19 uses BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 and TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene