该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Zellkonverter。
生物导体版本:3.12
提供了在Python Anndata对象和单圈Perlexperiment对象之间转换的方法。这些主要旨在由下游生物导体包装包装Python方法进行单细胞数据分析。它还包括用于读取和编写用于将AnnData对象保存到磁盘的H5AD文件的功能。
作者:卢克·扎皮亚(Luke Zappia)[AUT,CRE],亚伦·伦[自动]
维护者:Luke Zappia
引用(从r内,输入引用(“ Zellkonverter”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ zellkonverter”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Zellkonverter”)
html | R脚本 | 转换为从Anndata转换为SingleCellexperiments |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | DataImport,,,,datarepresentation,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.0.3 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | |
进口 | 矩阵,,,,蛇怪,,,,网状,,,,Singlecellexperiment(> = 1.11.6),总结性特征,,,,延迟, 方法,S4VECTORS,UTILS |
链接 | |
建议 | COVR,,,,拼写,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,scrnaseq,,,,HDF5Array,,,,RHDF5 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/theislab/zellkonverter |
BugReports | https://github.com/theislab/zellkonverter/issues |
取决于我 | |
进口我 | Velociraptor |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | zellkonverter_1.0.3.tar.gz |
Windows二进制 | zellkonverter_1.0.3.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | zellkonverter_1.0.3.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zellkonverter |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/zellkonverter |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/zellkonverter/ |
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