Zellkonverter

doi:10.18129/b9.bioc.zellkonverter

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Zellkonverter

scrna-seq对象之间的转换

生物导体版本:3.12

提供了在Python Anndata对象和单圈Perlexperiment对象之间转换的方法。这些主要旨在由下游生物导体包装包装Python方法进行单细胞数据分析。它还包括用于读取和编写用于将AnnData对象保存到磁盘的H5AD文件的功能。

作者:卢克·扎皮亚(Luke Zappia)[AUT,CRE],亚伦·伦[自动]

维护者:Luke Zappia

引用(从r内,输入引用(“ Zellkonverter”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ zellkonverter”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Zellkonverter”)

html R脚本 转换为从Anndata转换为SingleCellexperiments
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.0.3
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看
进口 矩阵,,,,蛇怪,,,,网状,,,,Singlecellexperiment(> = 1.11.6),总结性特征,,,,延迟, 方法,S4VECTORS,UTILS
链接
建议 COVR,,,,拼写,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,scrnaseq,,,,HDF5Array,,,,RHDF5
系统要求
增强
URL https://github.com/theislab/zellkonverter
BugReports https://github.com/theislab/zellkonverter/issues
取决于我
进口我 Velociraptor
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 zellkonverter_1.0.3.tar.gz
Windows二进制 zellkonverter_1.0.3.zip
MacOS 10.13(高山脉) zellkonverter_1.0.3.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zellkonverter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/zellkonverter
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/zellkonverter/
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