该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Yaqcaffy。
生物导体版本:3.12
使用MAQC参考数据集对人类全基因组芯片的Affymetrix Genechip表达数据和可重复性分析的质量控制。
作者:Laurent Gatto
维护者:laurent Gatto
引用(从r内,输入引用(“ Yaqcaffy”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ yaqcaffy”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Yaqcaffy”)
R脚本 | Yaqcaffy:Affymetrix质量控制和MAQC可重复性 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 微阵列,,,,Onechannel,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件 |
版本 | 1.50.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.2(R-2.7)(13年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 简单(> = 2.19.3),方法 |
进口 | Stats4 |
链接 | |
建议 | maqcsubsetafx,,,,Affydata,,,,Xtable,,,,TCLTK2,tcltk |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | QCMetrics |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | yaqcaffy_1.50.0.tar.gz |
Windows二进制 | yaqcaffy_1.50.0.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | yaqcaffy_1.50.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yaqcaffy |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/yaqcaffy |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/yaqcaffy/ |
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