西瓜
DOI:10.18129 / B9.bioc.wateRmelon
这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅西瓜。
Illumina公司450甲基化阵列正常化和指标
Bioconductor版本:3.12
15口味的贝塔和三个性能指标,与方法对象由methylumi minfi包。
作者:伦纳德C Schalkwyk,露丝Pidsley,克洛伊CY Wong功能由Nizar Touleimat,马修Defrance,安德鲁•Teschendorff Jovana Maksimovic,泰勒Gorrie-Stone,路易斯·埃尔科
维修工:狮子座< lschal在essex.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“西瓜”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“西瓜”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“西瓜”)
| R脚本 | 西瓜\ Rpackage{}包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DNAMethylation,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel |
| 版本 | 1.34.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(8年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.10),Biobase,limma、方法、matrixStats,methylumi,光民,中华民国,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,illuminaio |
| 进口 | Biobase |
| 链接 | |
| 建议 | RPMM,IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19,IlluminaHumanMethylationEPICmanifest,irlba |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | minfi |
| URL | |
| 取决于我 | bigmelon,skewr |
| 进口我 | 冠军,肉 |
| 建议我 | RnBeads |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | wateRmelon_1.34.0.tar.gz |
| Windows二进制 | wateRmelon_1.34.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | wateRmelon_1.34.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wateRmelon |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/西瓜 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/wateRmelon/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
