uncoverappLib

DOI:10.18129 / B9.bioc.uncoverappLib

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见uncoverappLib

碱基对水平序列覆盖的临床评估的交互式图形应用

Bioconductor版本:3.12

一个闪亮的应用程序,包含一套图形和统计工具,以支持低覆盖率地区的临床评估。它显示了三个网页,每个网页提供了不同的分析模块:覆盖率分析,通过等位基因频率应用程序计算AF和二项分布。

作者:Emanuela Iovino [cre, aut], Tommaso Pippucci [aut]

维护者:Emanuela Iovino < Emanuela。Iovino在unibo, >

引文(从R内,输入引用(“uncoverappLib”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“uncoverappLib”)

超文本标记语言 R脚本 uncoverappLib
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 注释报道软件可视化
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于
进口 减价闪亮的shinyjsshinyBSshinyWidgetsshinycssloadersDTGvizHomo.sapiensopenxlsxcondformatstringrorg.Hs.eg.dbTxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGeneBiocFileCacherappdirsTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGenerlist跑龙套,EnsDb.Hsapiens.v75EnsDb.Hsapiens.v86OrganismDbiBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19processxRsamtoolsGenomicRanges
链接
建议 BiocStyleknitrtestthatrmarkdowndplyr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/Manuelaio/uncoverappLib
BugReports https://github.com/Manuelaio/uncoverappLib/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 uncoverappLib_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 uncoverappLib_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) uncoverappLib_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uncoverappLib
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/uncoverappLib
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/uncoverappLib/
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