此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见uncoverappLib.
Bioconductor版本:3.12
一个闪亮的应用程序,包含一套图形和统计工具,以支持低覆盖率地区的临床评估。它显示了三个网页,每个网页提供了不同的分析模块:覆盖率分析,通过等位基因频率应用程序计算AF和二项分布。
作者:Emanuela Iovino [cre, aut], Tommaso Pippucci [aut]
维护者:Emanuela Iovino < Emanuela。Iovino在unibo, >
引文(从R内,输入引用(“uncoverappLib”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“uncoverappLib”)
超文本标记语言 | R脚本 | uncoverappLib |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 注释,报道,软件,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | 减价,闪亮的,shinyjs,shinyBS,shinyWidgets,shinycssloaders,DT,Gviz,Homo.sapiens,openxlsx,condformat,stringr,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene,BiocFileCache,rappdirs,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,rlist跑龙套,EnsDb.Hsapiens.v75,EnsDb.Hsapiens.v86,OrganismDbi,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,processx,Rsamtools,GenomicRanges |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,testthat,rmarkdown,dplyr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/Manuelaio/uncoverappLib |
BugReports | https://github.com/Manuelaio/uncoverappLib/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | uncoverappLib_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | uncoverappLib_1.0.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | uncoverappLib_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uncoverappLib |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/uncoverappLib |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/uncoverappLib/ |
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