tweeDEseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.tweeDEseq

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅tweeDEseq。

RNA-seq数据分析使用Poisson-Tweedie分布的家庭

Bioconductor版本:3.12

微分表达式分析RNA-seq使用Poisson-Tweedie分布的家庭。

作者:胡安·冈萨雷斯R < jrgonzalez来。猫>和米克尔Esnaola < mesnaola来。与来自罗伯特Castelo <猫>(罗伯特。在upf.edu castelo >)

维修工:胡安·冈萨雷斯R < jrgonzalez在creal.cat >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tweeDEseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tweeDEseq”)

PDF	R脚本	tweeDEseq:分析使用Poisson-Tweedie RNA-seq数据分布的家庭
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(9.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.12.0)
进口	质量,limma,刨边机平行,cqn
链接
建议	tweeDEseqCountData,xtable
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.creal.cat/jrgonzalez/software.htm
取决于我
进口我	ptmixed
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	tweeDEseq_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	tweeDEseq_1.36.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	tweeDEseq_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tweeDEseq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tweeDEseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tweeDEseq/
包下载报告	下载数据