触发

DOI:10.18129 / B9.bioc.trigger

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见触发．

基因表达遗传学的转录调控推论

Bioconductor版本:3.12

这个R包为整合基因组数据的统计分析提供了工具，这些数据涉及基因型、高维中间性状(例如，基因表达、蛋白质丰度)和高阶性状(表型)的一些组合。该软件包包括以下功能:(1)构建遗传标记和基因表达之间的全局链接图;(2)分析基因表达的多位点连锁(上位性);(3)量化每个位点解释的全基因组变异比例，并确定eQTL热点;(4)估计成对因果基因调控概率，构建基因调控网络;(5)确定感兴趣的数量性状的因果基因。

作者:Lin S. Chen ， Dipen P. Sangurdekar 和John D. Storey

维护者:John D. Storey

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("trigger")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“触发”)

PDF	R脚本	触发教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneticVariability，遗传学，微阵列，单核苷酸多态性，软件
版本	1.36.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(9.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.14.0)，corpcor，qtl
进口	qvalue、方法、图形、股东价值分析
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	trigger_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	trigger_1.36.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	trigger_1.36.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trigger
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/trigger
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/trigger/
软件包下载报告	下载数据