TopConfects
doi：10.18129/b9.bioc.topconfects
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅TopConfects。
最高自信的效果大小
生物导体版本：3.12
通过自信效应大小进行排名，同时保持虚假发现率和错误的覆盖范围控制率。TopConfects是对治疗结果的替代表现，具有提高的可用性，消除了P值，而是提供置信度范围。主要应用程序是差异基因表达分析，以自信的log2折叠变化顺序排名，但可以将其应用于与相关标准误差的任何效应大小的集合。
作者：保罗·哈里森[AUT，CRE]
维护者：Paul Harrison
引用（从r内，输入引用（“ TopConfects”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ topconfects”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
BrowseVignettes（“ TopConfects”）
| html | R脚本 | TopConfects的概述 |
| html | R脚本 | 自信的折叠更改 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，多重组合，，，，rnaseq，，，，回归，，，，软件，，，，转录组学，，，，Mrnamicroarray |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（2年） |
| 执照 | LGPL-2.1 |文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.6.0） |
| 进口 | 方法，utils，stats，断言，，，，GGPLOT2 |
| 链接 | |
| 建议 | 林玛，，，，EDGER，，，，Statmod，，，，deseq2，，，，阿什，，，，NBPSEQ，，，，dplyr，，，，测试，，，，RESHAPE2，，，，花花公子，，，，readr，，，，org.at.tair.db，，，，AnnotationDbi，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/pfh/topconfects |
| BugReports | https://github.com/pfh/topconfects/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | metavolcanor，，，，Weitrix |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | topConfects_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | topConfects_1.6.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | topConfects_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/topconfects |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/topconfects |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/topconfects/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
