tidybulk

doi：10.18129/b9.bioc.tidybulk

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅tidybulk。

将转录组学带入整理

生物导体版本：3.12

这是一个实用程序功能的集合，可以以模块化，管道友好和整洁的方式对RNA测序数据进行探索和计算。

作者：Stefano Mangiola [AUT，CRE]，Maria Doyle [CTB]

维护者：gmail.com>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ tidybulk”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Tidybulk”）

html	R脚本	与基础r进行比较
html	R脚本	手稿代码 - 差分笔录丰度
html	R脚本	手稿代码 - 转录签名标识
html	R脚本	Tidybulk软件包的概述
PDF		参考手册

细节

生物浏览	测定域，，，，聚类，，，，差异性，，，，基因表达，，，，基础设施，，，，正常化，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，转录，，，，转录组学
版本	1.2.1
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（1年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0.0）
进口	蒂布尔，，，，readr，，，，dplyr，，，，马格里特，，，，花花公子，，，，Stringr，，，，rlang，，，，purrr，，，，预处理，统计，平行，utils，生命周期，，，，秤，，，，总结性特征， 方法
链接
建议	生物使用，，，，测试，，，，VCTR，，，，AnnotationDbi，，，，生物管理器，，，，rsubread，，，，E1071，，，，EDGER，，，，林玛，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，SVA，，，，ggally，，，，尼特，，，，QPDF，，，，COVR，，，，Seurat，，，，克恩斯门茶，，，，RTSNE，，，，S4VECTORS，，，，GGPLOT2，，，，widy，，，，clusterProfiler，，，，msigdbr，，，，deseq2，，，，扫帚，，，，生存，，，，引导，，，，betareg，，，，tidyheatmap，，，，帕西拉，，，，Ggrepel，，，，DevTools，，，，功能
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	tidybulk_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	tidybulk_1.2.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	tidybulk_1.2.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tidybulk
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/tidybulk
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/tidybulk/
软件包下载报告	下载统计