tidySingleCellExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.tidySingleCellExperiment

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见tidySingleCellExperiment

将singlecelexperiment带到Tidyverse

Bioconductor版本:3.12

tidysinglecel实验是一个适配器,它以tibble的形式抽象出' singlecel实验'容器,并允许使用'tidyverse'进行数据操作、绘图和嵌套。

作者:Stefano Mangiola [aut, cre]

维护者:Stefano Mangiola

引文(从R内,输入引用(“tidySingleCellExperiment”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" tidysinglecel实验")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“tidySingleCellExperiment”)

超文本标记语言 R脚本 tidysinglecel实验包概述
PDF 参考手册

细节

biocViews AssayDomain聚类DifferentialExpressionGeneExpression基础设施归一化质量控制RNASeq测序软件转录转录组
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 4.0.0),SingleCellExperiment
进口 dplyr宠物猫tidyrggplot2情节magrittrrlangpurrr生命周期,方法,utils,S4Vectorstidyselect省略支柱stringrclifansi
链接
建议 BiocStyletestthatknitr减价SingleCellSignalR食物tidyHeatmapigraphGGally矩阵uwotcelldexdittoSeq
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 tidySingleCellExperiment_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 tidySingleCellExperiment_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) tidySingleCellExperiment_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tidySingleCellExperiment
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ tidysinglecel实验
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tidySingleCellExperiment/
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