tRNAscanImport

DOI:10.18129 / B9.bioc.tRNAscanImport

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见tRNAscanImport

导入tRNAscan-SE结果文件作为GRanges对象

Bioconductor版本:3.12

该包将tRNAscan-SE的结果作为GRanges对象导入。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道

引文(从R内,输入引用(“tRNAscanImport”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tRNAscanImport")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“tRNAscanImport”)

超文本标记语言 R脚本 tRNAscanImport
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataImport预处理软件可视化WorkflowStep
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证 GPL-3 +文件许可证
取决于 R (>= 3.5),GenomicRangestRNA
进口 方法,stringrBiocGenericsBiostringsStructstringsS4VectorsIRangesXVectorGenomeInfoDbrtracklayerBSgenomeRsamtools
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthatggplot2BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport
BugReports https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport/issues
全靠我
进口我
建议我 StructstringstRNA
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 tRNAscanImport_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 tRNAscanImport_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) tRNAscanImport_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tRNAscanImport
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tRNAscanImport
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tRNAscanImport/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网