switchde

DOI:10.18129 / B9.bioc.switchde

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见switchde

跨越单细胞轨迹的开关样差异表达

Bioconductor版本:3.12

跨单细胞RNA-seq轨迹的开关样差异表达的推断和检测。

作者:Kieran Campbell [aut, cre]

维护者:Kieran Campbell

引文(从R内,输入引用(“switchde”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("switchde")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“switchde”)

超文本标记语言 R脚本 交换机包概述
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文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionImmunoOncologyRNASeq回归SingleCell软件转录组
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.4),SingleCellExperiment
进口 SummarizedExperimentdplyrggplot2、方法、统计
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyletestthatnumDerivtidyr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/kieranrcampbell/switchde
BugReports https://github.com/kieranrcampbell/switchde
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 switchde_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 switchde_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) switchde_1.16.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/switchde
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/switchde
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/switchde/
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