swfdr

DOI:10.18129 / B9.bioc.swfdr

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅swfdr。

Science-wise错误发现率和比例估计真正的零假设

Bioconductor版本:3.12

这个包允许用户估计science-wise错误发现率从贼鸥和韭菜,“实证估计大多数发表的医学研究是正确的,”2013年,生物统计学,使用一个EM方法由于舍入和审查。它还允许用户估计错误发现率条件,使用回归框架,根据博卡和韭菜,”一个直接的方法来估计错误发现率条件,”2018年,PeerJ。

作者:杰弗里·t .韭菜Leah贼鸥Simina m·博卡Tomasz Konopka

维修工:Simina m·博卡< smb310 georgetown.edu >杰弗里·t .韭菜< jtleek gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“swfdr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“swfdr”)

PDF	R脚本	计算covariate-adjusted q值
PDF	R脚本	教程为swfdr包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MultipleComparison,软件,StatisticalMethod
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(4年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.4)
进口	方法、样条函数stats4,统计数据
链接
建议	dplyr,ggplot2,BiocStyle,knitr,qvalue,reshape2,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/leekgroup/swfdr
BugReports	https://github.com/leekgroup/swfdr/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	swfdr_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	swfdr_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	swfdr_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/swfdr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ swfdr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/swfdr/
包下载报告	下载数据