subseq

doi:10.18129/b9.bioc.subseq

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅subseq

高通量测序计数数据的子采样

生物导体版本:3.12

高吞吐量测序计数数据的子采样用于实验设计和分析。

作者:大卫·罗宾逊(David Robinson),约翰·D·斯托里(John D. Storey),由安德鲁·J·巴斯(Andrew J.

维护者:Andrew J. Bass ,John D. Storey

引用(从r内,输入引用(“ Subseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ subseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ subseq”)

PDF R脚本 SubSeq示例
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(5。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.2)
进口 Data.Table,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,GGPLOT2,,,,马格里特,,,,QVALUE(> = 1.99),消化,,,,生物酶
链接
建议 林玛,,,,EDGER,,,,deseq2,,,,dexseq(> = 1.9.7),测试,,,,尼特
系统要求
增强
URL http://github.com/storeylab/subseq
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 subseq_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 subseq_1.20.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) subseq_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/subseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/subseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/subseq/
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