该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅subseq。
生物导体版本:3.12
高吞吐量测序计数数据的子采样用于实验设计和分析。
作者:大卫·罗宾逊(David Robinson),约翰·D·斯托里(John D. Storey),由安德鲁·J·巴斯(Andrew J.
维护者:Andrew J. Bass
引用(从r内,输入引用(“ Subseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ subseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ subseq”)
R脚本 | SubSeq示例 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.20.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(5。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.2) |
进口 | Data.Table,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,GGPLOT2,,,,马格里特,,,,QVALUE(> = 1.99),消化,,,,生物酶 |
链接 | |
建议 | 林玛,,,,EDGER,,,,deseq2,,,,dexseq(> = 1.9.7),测试,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://github.com/storeylab/subseq |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | subseq_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | subseq_1.20.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | subseq_1.20.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/subseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/subseq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/subseq/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |