Srnadiff
doi：10.18129/b9.bioc.srnadiff
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅Srnadiff。
从RNA-seq数据中找到差异表达的未注释的基因组区域
生物导体版本：3.12
SRNADIFF是一个软件包，在不依赖现有注释的情况下，在基础分辨率级别发现与RNA-Seq数据的区域不同。为此，包装实现了识别的 - 然后是注向方法，该方法基于结合两种管道方法的想法。
作者：Zytnicki Matthias [AUT，CRE]，Gonzalez Ignacio [AUT]
维护者：zytnicki matthias
引用（从r内，输入引用（“ Srnadiff”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ srnadiff”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Srnadiff”）
| html | R脚本 | Srnadiff包 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 覆盖范围，，，，差异性，，，，表观遗传学，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，预处理，，，，SmallRNA，，，，软件，，，，统计信息 |
| 版本 | 1.10.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（3年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | RCPP（> = 0.12.8），方法，DevTools，，，，S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，rtracklayer，，，，总结性特征，，，，iranges，，，，基因组机，，，，deseq2，，，，rsamtools，，，，GenomicFeatures，，，，基因组签名，grdevices，GVIZ，，，，生物比较，，，，生物管理器，，，，生物使用 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，测试 |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | srnadiff_1.10.1.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | srnadiff_1.10.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/srnadiff |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/srnadiff |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/srnadiff/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
