spqn

DOI:10.18129 / B9.bioc.spqn

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见spqn．

空间分位数归一化

Bioconductor版本:3.12

spqn包实现了空间分位数规范化。该方法是为了去除由基因表达数据构建的相关矩阵中的均值相关关系而开发的。它可以作为共表达式分析之前的预处理步骤。

作者:Yi Wang [cre, aut]， Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:Yi Wang

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("spqn")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“spqn”)

超文本标记语言	R脚本	spqn用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GraphAndNetwork，NetworkInference，归一化，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，ggplot2，ggridges，SummarizedExperiment，BiocGenerics
进口	图形，统计，效用，matrixStats
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown、工具、spqnData(> = 0.99.3),RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hansenlab/spqn
BugReports	https://github.com/hansenlab/spqn/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	spqn_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	spqn_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	spqn_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spqn
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/spqn
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/spqn/
软件包下载报告	下载数据