spqn

DOI:10.18129 / B9.bioc.spqn

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见spqn

空间分位数归一化

Bioconductor版本:3.12

spqn包实现了空间分位数规范化。该方法是为了去除由基因表达数据构建的相关矩阵中的均值相关关系而开发的。它可以作为共表达式分析之前的预处理步骤。

作者:Yi Wang [cre, aut], Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:Yi Wang

引文(从R内,输入引用(“spqn”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("spqn")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“spqn”)

超文本标记语言 R脚本 spqn用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GraphAndNetworkNetworkInference归一化软件
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0),ggplot2ggridgesSummarizedExperimentBiocGenerics
进口 图形,统计,效用,matrixStats
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown、工具、spqnData(> = 0.99.3),RUnit
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/hansenlab/spqn
BugReports https://github.com/hansenlab/spqn/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 spqn_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 spqn_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) spqn_1.2.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spqn
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/spqn
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/spqn/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网