spicyr

doi:10.18129/b9.bioc.spicyr

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅spicyr

原位细胞仪数据的空间分析

生物导体版本:3.12

Spicyr提供了一系列功能,以帮助分析免疫荧光和质量细胞术成像数据以及其他可以深入表型单个细胞及其空间位置的测定法。

作者:Nicolas Canete [Aut],Ellis Patrick [AUT,CRE]

维护者:埃利斯·帕特里克(Ellis Patrick)

引用(从r内,输入引用(“ Spicyr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ spicyr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Spicyr”)

html R脚本 分段介绍
html R脚本 辛辣简介
PDF 参考手册

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.2.1
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(1年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 4.0.0)
进口 GGPLOT2,,,,凹者,,,,生物比较,,,,spatstat.core,,,,spatstat.geom,,,,lmertest,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,LME4, 方法,MGCV,,,,pheatmap,,,,rlang,grdevices,iranges,统计Data.Table,,,,dplyr,,,,花花公子
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/ellispatrick/spicyr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Spicyr_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 spicyr_1.2.1.zip
MacOS 10.13(高山脉) Spicyr_1.2.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spicyr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/spicyr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/spicyr/
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