该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅紧身。
生物导体版本:3.12
包装器查询通过Clue.io Rest API获得的L1000元数据以及用于处理Lincs GCTX文件的帮助者,提取有趣的数据集,转换为SummarizedExperiment对象以及执行这些数据集的简化差分表达分析的设施。
作者:Eric J. Kort
维护者:Eric J. Kort
引用(从r内,输入引用(“ Slinky”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ slinky”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Slinky”)
html | R脚本 | Lincs分析与Slinky |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | DataImport,,,,差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,图案表格,,,,软件,,,,第三派对人 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(2。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.5.0) |
进口 | 总结性特征,,,,卷曲,,,,dplyr,,,,foreach,,,,httr,统计,utils,方法,readr,,,,RHDF5,,,,jsonlite,,,,花花公子 |
链接 | |
建议 | Geode,,,,多帕尔,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,GGPLOT2,,,,RTSNE,,,,生物酶,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Slinky_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | slinky_1.8.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Slinky_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/slinky |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/斜纹 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/slinky/ |
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