紧身

doi:10.18129/b9.bioc.slinky

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅紧身

将乐趣放在Lincs L1000数据分析中

生物导体版本:3.12

包装器查询通过Clue.io Rest API获得的L1000元数据以及用于处理Lincs GCTX文件的帮助者,提取有趣的数据集,转换为SummarizedExperiment对象以及执行这些数据集的简化差分表达分析的设施。

作者:Eric J. Kort

维护者:Eric J. Kort

引用(从r内,输入引用(“ Slinky”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ slinky”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Slinky”)

html R脚本 Lincs分析与Slinky
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 DataImport,,,,差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,图案表格,,,,软件,,,,第三派对人
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(2。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.5.0)
进口 总结性特征,,,,卷曲,,,,dplyr,,,,foreach,,,,httr,统计,utils,方法,readr,,,,RHDF5,,,,jsonlite,,,,花花公子
链接
建议 Geode,,,,多帕尔,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,GGPLOT2,,,,RTSNE,,,,生物酶,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Slinky_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 slinky_1.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Slinky_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/slinky
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/斜纹
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/slinky/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网