simpleaffy

DOI:10.18129 / B9.bioc.simpleaffy

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此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见simpleaffy．

非常简单的Affymetrix数据的高级分析

Bioconductor版本:3.12

提供高级函数，用于读取Affy . cel文件、表型数据，然后用它计算简单的东西，如t检验、折叠变化等。大量使用affy库。还具有一些基本的散点图功能和机制，用于生成高分辨率的日志数字…

作者:Crispin J Miller

维护者:Crispin Miller

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("simpleaffy")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“simpleaffy”)

PDF	R脚本	simpleaffy底漆
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	注释，DataImport，DifferentialExpression，微阵列，OneChannel，预处理，质量控制，ReportWriting，软件，转录，可视化
版本	2.66.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 16年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 2.0.0)，方法，utils, grDevices，图形，统计，BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase，affy(> = 1.33.6),genefilter，gcrma
进口	方法，utils, grDevices，图形，统计，BiocGenerics，Biobase，affy，genefilter，gcrma
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
全靠我	yaqcaffy
进口我	affyQCReport，arrayMvout
建议我	AffyExpress，ArrayTools，肘
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	simpleaffy_2.66.0.tar.gz
Windows二进制	simpleaffy_2.66.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	simpleaffy_2.66.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simpleaffy
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/simpleaffy
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/simpleaffy/
软件包下载报告	下载数据