similaRpeak

DOI:10.18129 / B9.bioc.similaRpeak

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅similaRpeak

指标来估计两个ChIP-Seq概要文件之间的相似程度

Bioconductor版本:3.12

这个包计算指标分配ChIP-Seq概要文件之间的相似程度。

作者:阿斯特丽德Deschenes (cre, aut),埃尔莎Bernatchez (aut),查尔斯·乔利Beauparlant (aut),法比克劳德无痛分娩法(aut) Rawane Samb (aut),帕斯卡Belleau (aut) Arnaud所有权(aut)

维护人员:阿斯特丽德Deschenes < adeschen hotmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“similaRpeak”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“similaRpeak”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“similaRpeak”)

HTML R脚本 两个ChIP-Seq配置文件之间的相似性
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BiologicalQuestion,ChIPSeq,DifferentialExpression,遗传学,MultipleComparison,软件
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(6年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R6(> = 2.0)
进口 统计数据
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,knitr,Rsamtools,GenomicAlignments,rtracklayer,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/adeschen/similaRpeak
BugReports https://github.com/adeschen/similaRpeak/issues
取决于我
进口我
建议我 metagene,metagene
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 similaRpeak_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 similaRpeak_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉) similaRpeak_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/similaRpeak
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ similaRpeak
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/similaRpeak/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网