siggenes

DOI:10.18129 / B9.bioc.siggenes

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见siggenes．

使用SAM和Efron的经验贝叶斯方法进行多重测试

Bioconductor版本:3.12

利用微阵列显著性分析(SAM)和经验贝叶斯微阵列分析(EBAM)鉴定差异表达基因和估计错误发现率(FDR)。

作者:Holger Schwender

维护者:Holger Schwender < Holger。SCHW在gmx.de>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("siggenes")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“siggenes”)

超文本标记语言		identify.sam.html
超文本标记语言		plot.ebam.html
超文本标记语言		plot.finda0.html
超文本标记语言		plot.sam.html
超文本标记语言		print.ebam.html
超文本标记语言		print.finda0.html
超文本标记语言		print.sam.html
PDF	R脚本	siggenes手册
PDF		siggenesRnews.pdf
超文本标记语言		summary.ebam.html
超文本标记语言		summary.sam.html
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，ExonArray，GeneExpression，微阵列，MultipleComparison，单核苷酸多态性，软件
版本	1.64.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 16年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	Biobase，乘，样条，方法
进口	stats4, grDevices，图形，统计，scrime(> = 1.2.5)
链接
建议	affy，注释，genefilter，KernSmooth
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	KCsmart
进口我	coexnet，DAPAR，DeSousa2013，minfi，三人组，XDE
建议我	GCSscore，logicFS
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	siggenes_1.64.0.tar.gz
Windows二进制	siggenes_1.64.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	siggenes_1.64.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siggenes
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/siggenes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/siggenes/
软件包下载报告	下载数据