shinyMethyl

DOI:10.18129 / B9.bioc.shinyMethyl

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见shinyMethyl．

Illumina甲基化阵列的交互式可视化

Bioconductor版本:3.12

可视化Illumina甲基化阵列数据的交互式工具。支持450k和EPIC数组。

作者:Jean-Philippe Fortin [cre, aut]， Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:Jean-Philippe Fortin

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("shinyMethyl")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“shinyMethyl”)

PDF	R脚本	shinyMethyl: Illumina 450K甲基化阵列的交互式可视化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，微阵列，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),闪亮的(> = 0.13.2),minfi(> = 1.18.2),IlluminaHumanMethylation450kmanifest，matrixStats， r (>= 3.0.0)
进口	RColorBrewer
链接
建议	shinyMethylData，minfiData，BiocStyle，RUnit，消化，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	shinyMethyl_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	shinyMethyl_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	shinyMethyl_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/shinyMethyl
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/shinyMethyl
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/shinyMethyl/
软件包下载报告	下载数据