shinyMethyl

DOI:10.18129 / B9.bioc.shinyMethyl

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见shinyMethyl

Illumina甲基化阵列的交互式可视化

Bioconductor版本:3.12

可视化Illumina甲基化阵列数据的交互式工具。支持450k和EPIC数组。

作者:Jean-Philippe Fortin [cre, aut], Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:Jean-Philippe Fortin

引文(从R内,输入引用(“shinyMethyl”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("shinyMethyl")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“shinyMethyl”)

PDF R脚本 shinyMethyl: Illumina 450K甲基化阵列的交互式可视化
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation微阵列预处理质量控制软件TwoChannel
版本 1.26.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),闪亮的(> = 0.13.2),minfi(> = 1.18.2),IlluminaHumanMethylation450kmanifestmatrixStats, r (>= 3.0.0)
进口 RColorBrewer
链接
建议 shinyMethylDataminfiDataBiocStyleRUnit消化knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 shinyMethyl_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 shinyMethyl_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) shinyMethyl_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/shinyMethyl
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/shinyMethyl
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/shinyMethyl/
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