seqTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqTools

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见seqTools．

fastq文件的核苷酸、序列和质量内容分析

Bioconductor版本:3.12

分析未压缩和压缩fastq文件的读取长度，phred分数和字母频率和DNA k-mers。

作者:沃尔夫冈·凯泽斯

维护者:Wolfgang Kaisers < Kaisers at med.uni-duesseldorf.de>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“seqTools”)

PDF	R脚本	简介
PDF	R脚本	seqTools_qual_report
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	质量控制，测序，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,跑龙套,zlibbioc
进口
链接	zlibbioc
建议	RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	qckitfastq
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	seqTools_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	seqTools_1.24.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	seqTools_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqTools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/seqTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/seqTools/
软件包下载报告	下载数据