scry

doi:10.18129/b9.bioc.scry

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅scry

高维数据的小计分析方法

生物导体版本:3.12

许多现代的生物数据集由小数组成,这些计数不符合标准线性高斯方法,例如主成分分析。该软件包提供了基于计数的功能选择和缩小算法的实现。这些方法可用于促进对任何高维数据(例如单细胞RNA-seq)的无监督分析。

作者:凯利街[AUT,CRE],F。WilliamTownes [AUT,CPH],Davide Risso [AUT],Stephanie Hicks [aut]

维护者:凯利街<街。

引用(从r内,输入引用(“ scry”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scry”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Scry”)

html R脚本 扫描方法的概述
html R脚本 较大数据集的scry方法
PDF 参考手册

细节

生物浏览 维度,,,,基因表达,,,,正常化,,,,委托人,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(1年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 4.0),统计,方法
进口 延迟,,,,GLMPCA(> = 0.2.0),HDF5Array,,,,矩阵,,,,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,生物兴奋
链接
建议 生物基因,,,,COVR,,,,DuoClustering2018,,,,GGPLOT2,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,tenxpbmcdata,,,,测试
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scry.html
BugReports https://github.com/kstreet13/scry/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scry_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 scry_1.2.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) scry_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scry
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/scry
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scry/
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