该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅烤饼。
生物导体版本:3.12
Scone是一个R包,用于比较和对单细胞RNA-SEQ和其他高通量分析的不同归一化方案的性能进行比较和排名。
作者:Michael Cole [AUT,CPH],Davide Risso [AUT,CRE,CPH]
维护者:davide risso
引用(从r内,输入引用(“ Scone”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scone”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Scone”)
html | R脚本 | Scone小插图 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(4年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.4),方法,总结性特征 |
进口 | 图形,统计,utils,香气,,,,生物比较,,,,班级,,,,簇,,,,组成,,,,diptest,,,,EDGER,,,,FPC,,,,GPLOTS,grdevices,Hexbin,,,,林玛,,,,矩阵,,,,混音工具,,,,rcolorbrewer,,,,引导,,,,RHDF5,,,,Ruvseq,,,,rarpack |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,DT,,,,GGPLOT2,,,,尼特,,,,miniui,,,,NMF,,,,情节,,,,RESHAPE2,,,,rmarkDown,,,,斯克兰,,,,scrnaseq,,,,闪亮的,,,,测试,,,,Visnetwork,,,,多帕尔,,,,batchjobs |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/yoseflab/scone/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | scone_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | scone_1.14.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | scone_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scone |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/scone |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scone/ |
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