烤饼

doi:10.18129/b9.bioc.scone

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅烤饼

归一化表达数据的单元单元概述

生物导体版本:3.12

Scone是一个R包,用于比较和对单细胞RNA-SEQ和其他高通量分析的不同归一化方案的性能进行比较和排名。

作者:Michael Cole [AUT,CPH],Davide Risso [AUT,CRE,CPH]

维护者:davide risso

引用(从r内,输入引用(“ Scone”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scone”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Scone”)

html R脚本 Scone小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(4年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.4),方法,总结性特征
进口 图形,统计,utils,香气,,,,生物比较,,,,班级,,,,,,,,组成,,,,diptest,,,,EDGER,,,,FPC,,,,GPLOTS,grdevices,Hexbin,,,,林玛,,,,矩阵,,,,混音工具,,,,rcolorbrewer,,,,引导,,,,RHDF5,,,,Ruvseq,,,,rarpack
链接
建议 生物使用,,,,DT,,,,GGPLOT2,,,,尼特,,,,miniui,,,,NMF,,,,情节,,,,RESHAPE2,,,,rmarkDown,,,,斯克兰,,,,scrnaseq,,,,闪亮的,,,,测试,,,,Visnetwork,,,,多帕尔,,,,batchjobs
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/yoseflab/scone/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scone_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 scone_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) scone_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scone
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/scone
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scone/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网