scds

DOI:10.18129 / B9.bioc.scds

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见scds．

单细胞RNA测序数据的双序列硅内注释

Bioconductor版本:3.12

在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中，细胞组合有时被认为是单细胞(双胞)。scds包提供了在scRNA-seq数据中计算注释双态的方法。

作者:Dennis Kostka [aut, cre]， Bais Abha [aut]

维护者:Dennis Kostka < Kostka at pitt.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (scds)

超文本标记语言	R脚本	介绍scds包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，GeneExpression，预处理，质量控制，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	矩阵，S4Vectors，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，xgboost，方法，统计，dplyr，pROC
链接
建议	BiocStyle，knitr，rsvd，Rtsne，嘘，cowplot
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	singleCellTK
建议我	ExperimentSubset，muscData
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scds_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	scds_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scds_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scds
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scds
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scds/
软件包下载报告	下载数据