sapFinder

DOI:10.18129 / B9.bioc.sapFinder

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.12版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅sapFinder。

包变体肽在猎枪蛋白质组学检测和可视化。

Bioconductor版本:3.12

sapFinder开发自动化(1)variation-associated数据库建设、数据库搜索(2),(3)后处理,(4)基于html报告生成猎枪蛋白质组学。

作者:Shaohang徐,Bo温家宝

维护人员:徐Shaohang < xsh。斯凯在gmail.com >, Bo温家宝<文博genomics.cn >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sapFinder”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“sapFinder”)

PDF	R脚本	sapFinder装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,RNASeq,ReportWriting,单核苷酸多态性,软件,可视化
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(7年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.0.0),rTANDEM(> = 1.3.5)
进口	pheatmap,Rcpp(> = 0.10.6)、图形、grDevices统计,跑龙套
链接	Rcpp
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sapFinder_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	sapFinder_1.28.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sapFinder
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sapFinder
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sapFinder/
包下载报告	下载数据