安全

DOI:10.18129 / B9.bioc.safe

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见安全

功能与表达的显著性分析

Bioconductor版本:3.12

SAFE是一种在基因表达实验中检测功能类别的重采样方法。SAFE可以应用于两样本和多类比较,或简单的线性回归。其他实验设计也可以通过用户定义的函数来适应。

作者:威廉·t·巴里

维护者:Ludwig Geistlinger < Ludwig。Geistlinger在sph.cuny.edu>

引文(从R内,输入引用(“安全”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("safe")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“安全”)

PDF R脚本 安全手册
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneSetEnrichment通路软件StatisticalMethod
版本 3.30.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 16年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.4.0),AnnotationDbiBiobase、方法、SparseM
进口
链接
建议 GO.dbPFAM.dbreactome.dbhgu133a.dbbreastCancerUPP生存foreachdoRNGRgraphvizGOstats
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 PCGSE
进口我 EGSEAEnrichmentBrowser
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 safe_3.30.0.tar.gz
Windows二进制 safe_3.30.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) safe_3.30.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/safe
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/safe
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/safe/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网