此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见安全.
Bioconductor版本:3.12
SAFE是一种在基因表达实验中检测功能类别的重采样方法。SAFE可以应用于两样本和多类比较,或简单的线性回归。其他实验设计也可以通过用户定义的函数来适应。
作者:威廉·t·巴里
维护者:Ludwig Geistlinger < Ludwig。Geistlinger在sph.cuny.edu>
引文(从R内,输入引用(“安全”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("safe")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“安全”)
R脚本 | 安全手册 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod |
版本 | 3.30.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 16年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.4.0),AnnotationDbi,Biobase、方法、SparseM |
进口 | |
链接 | |
建议 | GO.db,PFAM.db,reactome.db,hgu133a.db,breastCancerUPP,生存,foreach,doRNG,Rgraphviz,GOstats |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | PCGSE |
进口我 | EGSEA,EnrichmentBrowser |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | safe_3.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | safe_3.30.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | safe_3.30.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/safe |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/safe |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/safe/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |