rnaEditr

DOI:10.18129 / B9.bioc.rnaEditr

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rnaEditr。

统计分析的RNA编辑网站和hyper-editing地区

Bioconductor版本:3.12

RNAeditr分析特定站点RNA编辑事件以及hyper-editing地区。可以测试二进制编辑频率,连续或生存的结果。多个协变量的变量以及交互作用也可以纳入统计模型。

作者:张兰屿(aut (cre),加布里埃尔奥多姆(aut),蒂亚戈席尔瓦(aut) Lissette戈麦斯(aut),莉莉王(aut)

维护人员:张兰屿< jennyzly2016 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rnaEditr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rnaEditr”)

HTML	R脚本	介绍rnaEditr
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,表观遗传学,FeatureExtraction,GeneTarget,RNASeq,回归,软件,生存
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	GenomicRanges,IRanges,BiocGenerics,GenomeInfoDb,bumphunter,S4Vectors统计数据,生存,logistf,plyr,corrplot
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/TransBioInfoLab/rnaEditr
BugReports	https://github.com/TransBioInfoLab/rnaEditr/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rnaEditr_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	rnaEditr_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	rnaEditr_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaEditr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rnaEditr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rnaEditr/
包下载报告	下载数据