RibosomeProfilingQC
doi：10.18129/b9.bioc.ribosomeprofilingqc
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅RibosomeProfilingQC。
核糖体分析质量控制
生物导体版本：3.12
Ribo-Seq（也称为核糖体分析或足迹）通过直接量化核糖体保护的片段（RPFS）进行翻译（与RNA-Seq不同，与RNA-Seq相比）。该软件包为核糖体分析的质量评估提供了工具。此外，它可以预处理核糖序列数据以进行后续差分分析。
作者：Jianhong OU [AUT，CRE]
，Mariah Hoye [aut]
维护者：jianhong ou
引用（从r内，输入引用（“ RibosomeProfilingQC”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ ribosomeprofilingqc”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ ribosomeprofilingqc”）
| html | R脚本 | RibosomeProfilingQC Vignette |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 覆盖范围，，，，结肠管制，，，，QualityControl，，，，核糖，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.2.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.11（R-4.0）（1年） |
| 执照 | GPL（> = 3） +文件执照 |
| 要看 | r（> = 4.0），基因组机 |
| 进口 | AnnotationDbi，，，，生物基因，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，EDASEQ，，，，基因组签名，，，，GenomicFeatures，，，，GenomeInfodB，，，，iranges， 方法，Motifstack，，，，rtracklayer，，，，rsamtools，，，，Ruvseq，，，，rsubread，，，，S4VECTORS，，，，xvector，，，，GGPLOT2，，，，ggfittext，，，，秤，，，，Ggrepel，utils，簇，统计，图形，网格 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物使用，，，，尼特，，，，BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER10，，，，EDGER，，，，林玛，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ribosomeProfilingqc_1.2.1.tar.gz |
| Windows二进制 | ribosomeProfilingqc_1.2.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | ribosomeProfilingqc_1.2.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ribosomeprofilingqc |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ribosomeprofilingqc |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ribosomeprofilingqc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
