rfaRm

DOI:10.18129 / B9.bioc.rfaRm

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rfaRm

Rfam数据库的R接口

Bioconductor版本:3.12

rfaRm为RNA家族的Rfam数据库提供了一个客户端接口。可检索的数据包括RNA家族、二级结构图像、协方差模型、每个家族中的序列、导致家族识别的比对和点括号格式的二级结构。

作者:Lara Selles Vidal, Rafael Ayala, Guy-Bart Stan, Rodrigo Ledesma-Amaro

维护者:Lara Selles Vidal < Lara。在imperial.ac出售。英国>,拉斐尔阿亚拉

引文(从R内,输入引用(“rfaRm”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rfaRm")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rfaRm”)

超文本标记语言 R脚本 rfaRm
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportFunctionalGenomicsMultipleSequenceAlignment软件ThirdPartyClient可视化
版本 1.2.1 "
在Bioconductor BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 httrstringirsvg魔法data.tableBiostrings跑龙套,房车xml2IRangesS4Vectors
链接
建议 R4RNAtreeioknitrBiocStylermarkdownBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 rfaRm_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 rfaRm_1.2.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra) rfaRm_1.2.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfaRm
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rfaRm
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rfaRm/
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Bioconductor

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