restfulSE

DOI:10.18129 / B9.bioc.restfulSE

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见restfulSE

通过summarizeexperiment接口访问类似矩阵的HDF5服务器内容或BigQuery内容

Bioconductor版本:3.12

这个包提供了通过操作summarizeexperimental -like对象来与远程数据存储接口的函数和类。

作者:Vincent Carey [aut], Shweta Gopaulakrishnan [cre, aut]

维护者:Shweta Gopaulakrishnan

引文(从R内,输入引用(“restfulSE”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("restfulSE")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“restfulSE”)

PDF R脚本 restfulSE—SE接口到远程HDF5的实验
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 报道基础设施测序SingleCell软件转录组
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.6),SummarizedExperimentDelayedArray
进口 效用,统计,方法,S4VectorsBiobasereshape2AnnotationDbiDBIGO.dbrhdf5clientdplyr(> =是0.7.1),magrittrbigrqueryExperimentHubAnnotationHubrlang
链接
建议 knitrtestthatRtsneorg.Mm.eg.dborg.Hs.eg.dbBiocStylerestfulSEData
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 restfulSE_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 restfulSE_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) restfulSE_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/restfulSE
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/restfulSE
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/restfulSE/
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