regutools

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅regutools。

regutools: R包从RegulonDB数据提取

Bioconductor版本:3.12

RegulonDB收集,统一和集中数百实验近20年来的数据,被认为是一个的参考点在大肠杆菌K12的转录调控。在这里,我们现在regutools R包,以方便编程访问RegulonDB计算生物学中的数据。regutools为研究人员提供了写作的可能性可再生的工作流与RegulonDB自动查询。regutools包之间充当桥梁RegulonDB数据和Bioconductor生态系统通过重用的数据结构和统计方法由其他Bioconductor包。我们将演示的集成与Bioconductor regutools通过分析DNA转录因子结合位点从RegulonDB和转录调控网络。我们预料regutools将成为一个有用的构建块在我们进步,进一步了解基因调控网络。

作者:Joselyn查韦斯(aut (cre)《布兰诗歌Barberena-Jonas (aut),耶稣大肠Sotelo-Fonseca (aut)何塞•Alquicira-Hernandez(施),Heladia萨尔加多(施)列奥纳多·达·芬奇Collado-Torres (aut)- - -亚历杭德罗•雷耶斯(aut)

维护人员:Joselyn查韦斯< joselynchavezf gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“regutools”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“regutools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“regutools”)

HTML