地区
DOI:10.18129 / B9.bioc.regioneR
此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见地区．
基于排列试验的基因组区域关联分析
Bioconductor版本:3.12
regioneR提供了一个基于可定制排列测试的统计框架，以评估基因组区域集和其他基因组特征之间的关联。
作者:Anna Diez-Villanueva
维护者:Bernat Gel
引文(从R内，输入引用(“区域”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("regioneR")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“区域”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 地区的装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq，CopyNumberVariation，DNASeq，遗传学，MethylSeq，软件 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(6年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | GenomicRanges |
| 进口 | memoise，GenomicRanges，IRanges，BSgenome，Biostrings，rtracklayer，并行，图形，统计，utils，方法，GenomeInfoDb，S4Vectors、工具 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | karyoploteR |
| 进口我 | annotatr，ChIPpeakAnno，CNVfilteR，CopyNumberPlots，karyoploteR，RIPAT，UMI4Cats |
| 建议我 | CNVRanger |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | regioneR_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | regioneR_1.22.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | regioneR_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regioneR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/regioneR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/regioneR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
